Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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