Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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