Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPM6BQ13491 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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