Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
UBE2V1Q13404 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms