Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
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