Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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