Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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