Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.072e-8■□□□□ 10.8
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TARDBPQ13148 SNRNP70-209ENST00000601065 1757 ntTSL 320.78■□□□□ 0.922e-8■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SNRNP70-202ENST00000401730 3144 ntTSL 216.21■□□□□ 0.192e-8■□□□□ 10.8
TARDBPQ13148 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.022e-8■□□□□ 10.8
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TARDBPQ13148 ARHGAP11A-203ENST00000562481 620 ntTSL 35.5□□□□□ -1.533e-7■□□□□ 10.8
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TARDBPQ13148 FBXL13-206ENST00000448002 2582 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.038e-8■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.248e-8■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.288e-8■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.558e-8■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.858e-8■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 PDE7A-206ENST00000519626 522 ntTSL 425.11■■□□□ 1.618e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.98e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 XPO4-204ENST00000490513 914 ntTSL 420.5■□□□□ 0.878e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.88e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 PDE7A-205ENST00000519231 685 ntTSL 519.35■□□□□ 0.698e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.628e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 PCF11-203ENST00000530304 2649 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.558e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.328e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 UBE3D-204ENST00000430071 1352 ntTSL 517.02■□□□□ 0.318e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.278e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 TMEM175-221ENST00000515876 1007 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.268e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.28e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 TMEM175-213ENST00000509508 621 ntTSL 316.09■□□□□ 0.178e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 TMEM175-214ENST00000510493 1006 ntTSL 516.09■□□□□ 0.178e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 CRLF3-203ENST00000578692 1392 ntTSL 216.08■□□□□ 0.168e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 TMEM175-216ENST00000513952 2084 ntTSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.128e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.188e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.198e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 AFG3L1P-202ENST00000388970 1466 ntTSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 10.7
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TARDBPQ13148 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.478e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 UPF3A-210ENST00000493727 937 ntTSL 512.08□□□□□ -0.488e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.518e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.538e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 YWHAE-205ENST00000489287 465 ntTSL 210.72□□□□□ -0.698e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 TMEM175-205ENST00000504180 673 ntTSL 510.36□□□□□ -0.758e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 AFG3L1P-216ENST00000458301 2298 ntTSL 210.28□□□□□ -0.768e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 LARP4B-210ENST00000609318 4848 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.838e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 49.37□□□□□ -0.918e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -18e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 38.64□□□□□ -1.038e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 TMEM175-210ENST00000506669 292 ntTSL 57.98□□□□□ -1.138e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.178e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 CLEC16A-212ENST00000494853 1010 ntTSL 37.69□□□□□ -1.188e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 CORO1C-215ENST00000551044 567 ntTSL 37.47□□□□□ -1.218e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.248e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 KDM3B-207ENST00000510866 6324 ntTSL 1 (best)6.94□□□□□ -1.38e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 USP15-210ENST00000548836 579 ntTSL 36.76□□□□□ -1.338e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 NAP1L4-208ENST00000483643 690 ntTSL 26.56□□□□□ -1.368e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.398e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 KDM3B-204ENST00000507996 3034 ntTSL 26.19□□□□□ -1.428e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 KDM6A-205ENST00000433797 4324 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.438e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 STX2-202ENST00000344271 661 ntTSL 35.43□□□□□ -1.548e-6■□□□□ 10.7
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