Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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