Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms