Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBRQ0VD83 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms