Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms