Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSG1Q02413 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms