Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms