Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms