Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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