Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms