Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB25P57735 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms