Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms