Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRG3P56975 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NRG3P56975 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRG3P56975 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NRG3P56975 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRG3P56975 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRG3P56975 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG3P56975 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms