Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP6P55212 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms