Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP153P49790 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP153P49790 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP153P49790 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP153P49790 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP153P49790 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP153P49790 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms