Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCLCP48506 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCLCP48506 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCLCP48506 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCLCP48506 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms