Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNJ1P48048 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNJ1P48048 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms