Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms