Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms