Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 MICALL2-207ENST00000471899 899 ntTSL 217.41■□□□□ 0.388e-9■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 UBE2V1-218ENST00000490289 628 ntTSL 311.06□□□□□ -0.646e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 UBE2V1-213ENST00000470565 728 ntTSL 36.17□□□□□ -1.426e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 UBE2V1-210ENST00000462217 1095 ntTSL 55.42□□□□□ -1.546e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 UBE2V1-209ENST00000461960 649 ntTSL 54.71□□□□□ -1.666e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FAM214A-206ENST00000561543 931 ntTSL 328.04■■■□□ 2.081e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FAM214A-205ENST00000561490 547 ntTSL 42.2□□□□□ -2.061e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FAM214A-209ENST00000566768 576 ntTSL 31.35□□□□□ -2.191e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 CERS2-204ENST00000368949 1002 ntTSL 514.92□□□□□ -0.025e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.692e-9■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 HMGA2-208ENST00000537429 1527 ntTSL 1 (best)25.61■■□□□ 1.692e-9■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.692e-9■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.622e-9■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-9■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.442e-9■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 LTBP4-236ENST00000618486 567 ntTSL 417.73■□□□□ 0.438e-14■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.117e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 AGXT-202ENST00000470255 2638 ntTSL 220.18■□□□□ 0.827e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.797e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.497e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FOXA3-202ENST00000594297 538 ntTSL 317.67■□□□□ 0.427e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 515.14■□□□□ 0.017e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.027e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.047e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.177e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.227e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.142e-24■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-24■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.152e-24■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.565e-10■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 TMUB1-206ENST00000488752 584 ntTSL 224.55■■□□□ 1.525e-10■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 ABCC6-203ENST00000574094 2260 ntTSL 517.44■□□□□ 0.381e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 STARD9-204ENST00000563872 553 ntTSL 417.01■□□□□ 0.316e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 STARD9-205ENST00000564158 6049 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.576e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.396e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.75■□□□□ 0.436e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 516.82■□□□□ 0.286e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.286e-8■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.673e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.573e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-213ENST00000600105 635 ntTSL 321.87■■□□□ 1.093e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.083e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-203ENST00000594165 986 ntTSL 320.63■□□□□ 0.893e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.33e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 516.11■□□□□ 0.173e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-202ENST00000594151 995 ntTSL 516.01■□□□□ 0.153e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 214.87□□□□□ -0.033e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 CAPRIN2-205ENST00000454014 4398 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.219e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.279e-7■■■□□ 16.1
GTF2F1P35269 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 325.02■■□□□ 1.65e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 516.04■□□□□ 0.165e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 220.9■□□□□ 0.943e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 216.91■□□□□ 0.33e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.875e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 UTRN-208ENST00000433557 354 ntTSL 423.81■■□□□ 1.42e-6■■■□□ 16
GTF2F1P35269 UTRN-213ENST00000628146 597 ntTSL 25.99□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 16
GTF2F1P35269 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 16
GTF2F1P35269 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-6■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.497e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.497e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-204ENST00000578676 1078 ntTSL 323.09■■□□□ 1.297e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-207ENST00000580953 2082 ntTSL 523.02■■□□□ 1.287e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 EPAS1-202ENST00000449347 1067 ntTSL 321.47■■□□□ 1.037e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 EPAS1-207ENST00000467888 665 ntTSL 521.44■■□□□ 1.027e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 FAM169A-206ENST00000514200 751 ntTSL 419.91■□□□□ 0.787e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-208ENST00000582478 3107 ntTSL 1 (best)19.84■□□□□ 0.777e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-205ENST00000580793 1755 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.527e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-209ENST00000583784 2886 nt17.94■□□□□ 0.467e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-211ENST00000584515 994 ntTSL 217.16■□□□□ 0.347e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.247e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RPL5-201ENST00000315741 681 ntTSL 516.4■□□□□ 0.227e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.167e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 EPAS1-203ENST00000460015 558 ntTSL 415.61■□□□□ 0.097e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-212ENST00000584838 721 ntTSL 515.15■□□□□ 0.027e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.017e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.017e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.137e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.247e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RFNG-206ENST00000580928 302 ntTSL 511.63□□□□□ -0.557e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 FAM169A-202ENST00000506954 571 ntTSL 410.31□□□□□ -0.767e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 RPL5-204ENST00000470843 694 ntTSL 34.85□□□□□ -1.637e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-206ENST00000437553 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.326e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-216ENST00000557665 1331 ntTSL 511.74□□□□□ -0.536e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-203ENST00000398160 1613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.566e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-204ENST00000398163 1604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.566e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-205ENST00000398169 1631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.596e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-208ENST00000553516 669 ntTSL 210.91□□□□□ -0.666e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-202ENST00000358932 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.776e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-201ENST00000353689 1305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.956e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-214ENST00000556854 1294 ntTSL 58.19□□□□□ -1.16e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-213ENST00000556563 646 ntTSL 37.48□□□□□ -1.216e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-211ENST00000555348 505 ntTSL 44.27□□□□□ -1.736e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 CCNB1IP1-207ENST00000553291 392 ntTSL 32.95□□□□□ -1.946e-8■■■□□ 16
GTF2F1P35269 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-9■■■□□ 16
GTF2F1P35269 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.112e-9■■■□□ 16
GTF2F1P35269 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-9■■■□□ 16
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 185.4 ms