Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms