Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms