Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms