Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms