Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECHS1P30084 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECHS1P30084 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms