Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCAP28676 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCAP28676 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCAP28676 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms