Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms