Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA3P26006 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms