Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms