Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALB2P22676 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms