Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD247P20963 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD247P20963 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD247P20963 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms