Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRHP20396 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRHP20396 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRHP20396 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRHP20396 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRHP20396 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms