Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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PTPRAP18433 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PTPRAP18433 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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PTPRAP18433 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PTPRAP18433 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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PTPRAP18433 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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