Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPRP12270 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPRP12270 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPRP12270 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TPRP12270 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TPRP12270 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPRP12270 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRP12270 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms