Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT3P12035 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms