Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms