Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRPRAP08240 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms