Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms