Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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