Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms