Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA10O75578 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms