Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1O43719 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms