Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA2O43364 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms